2013年1月，《东莞市黄标车淘汰更新鼓励补贴方案》(以下简称《方案》)正式出炉，较之此前东莞市环保局公布的补贴方案，该方案更为细致。根据《方案》，30座以上的营运客运黄标车、4吨以上的营运货运黄标车都可获得最高1.8万元补助；补贴资金由市、镇两级财政各承担50%。而申请补贴则要经过五部门的审核。
根据《方案》，符合条件的机动车所有人，取得《报废汽车回收证明》，填写《东莞市营运黄标车提前淘汰补贴申报表》后，就可办理补贴手续。不过，申请了补贴的车主不能马上拿到补助。根据《方案》，补贴申请要经过5个部门的审核，其中公安交警部门审核车辆是否属于提前报废；交通部门审核车辆是否属于营运车辆；市环保部门审核车辆是否属于黄标车；市经信部门审核《报废汽车回收证明》的有效性；市财政部门审核车辆是否符合补贴条件。补贴时间为：市政府下发实施《东莞市黄标车辆淘汰更新实施方案》起，即2012年7月13日起，至2015年12月31日止。